Untuk menunjang percepatan peningkatan kinerja, PTPN XI telah melakukan kerja-sama dengan sejumlah pihak khususnya dalam bentuk penelitian dan uji lapang (kalibrasi) hasil-hasil penelitian sebelum dapat diaplikasikan secara luas.
Kerja-sama dengan mitra usaha
- PT. Agrimas Cipta Mandiri – Uji efikasi pupuk Real Strong Bio Organik
- PT. Jati Baik Inti Prima – Uji efikasi Herbisida Amegras & Sidafos serta pupuk Daun Super Green
- PT. Petrokimia Kayaku – Uji efikasi Herbisida Amexone, Maron & Starmin
- CV. Muncul Jaya – Uji efikasi pupuk Puja 168
- PT. Windu Kamukten – Uji efikasi Herbisida Amegras, Damin, Tarnat, DMA 6 & Karmex, Fungsida Delsene, Nurstar, & Equation Pro
- PT Pijar Nusa Pasifik – Uji efikasi pupuk pelangi, enrich, dan Si Hitam
- PT. Gaharu Niaga – Uji efikasi Herbisida Aladin
- PT. Syngenta – Uji efikasi Herbisida Gesapak
- PT. Jan Agro Beringin Group – Uji efikasi pupuk Beringin
- PT. Gunung Kartika Mandiri – Uji efikasi pupuk Azomite
- PT. Bogor Highgrow – Uji efikasi pupuk highgrow Super Tani
- PT. Petrosida – Uji efikasi pupuk kapur pertanian
- PT. Anugerah Mustika Ostindo – Uju efikasi pupuk Ostindo
- PT. Jaya Abadi Manunggal – Inti uji efikasi pupuk Nutrisi Saputra
Kerjasama dengan lembaga/ instansi dalam negeri
- Pusat Penelitian Perkebunan Gula – kerja-sama aplikasi kebun orientasi varietas dan introduksi varietas unggul baru lokal.
- Balai Penelitian Bioteknologi Genetika Tanaman Pangan (BALITBIOGENTAN) Bogor mengenai aplikasi varietas tebu transformasi genetika (transgenic)
- Universitas Jember – penelitian mengenai tanaman tebu transformasi gen metoda SPS (sucrose phospate syntase).
- Institut Teknologi Bandung – penelitian mengenai transformasi gen tanaman tebu metoda PFP (pyrophospate fructose phospo- fructokinase)
- Universitas Airlangga – penelitian mengenai produksi enzim bahan baku limbah pabrik gula
- Balai Penelitian dan Pengembangan Teknologi (BPPT) – penelitian tentang peningkatan mutu alkohol dan biogas
- Balai Penelitian dan Pengembangan Mutu Benih (BP2MB) – sertifikasi mutu benih kebun bibit di unit-unit usaha.
Kerjasama Luar Negeri
- Ajinomoto International Inc. Japan – penelitian tanaman tebu transgenic toleran kekeringan
- CIRAD Perancis – pengujian produksi multi lokasi tanaman tebu komersial ex luar negeri
- Program Uitzending Manager (PUM) pengganti dari The Nederland Management Cooperation – kerja-sama peningkatan kinerja petani, bidang tanaman, bidang pabrikasi dan pengolahan, bidang kesehatan / rumah sakit.