Untuk menunjang percepatan peningkatan kinerja, PTPN XI telah melakukan kerja-sama dengan sejumlah pihak khususnya dalam bentuk penelitian dan uji lapang (kalibrasi) hasil-hasil penelitian sebelum dapat diaplikasikan secara luas.
Kerja-sama dengan mitra usaha
- PT. Indo Aciditama Tbk. – Uji efikasi pupuk Pomi
- PT. Petrokimia Gresik – Uji efikasi pupuk organik Super Petro
- PT. Petrokimia Kayaku – Uji efikasi pupuk Petronio
- PT. Petrosida Gresik – Uji efikasi kapur pertanian
- PT. Nutrisi Pertanian – Uji efikasi pupuk Ergon Super
- PT. Windu Kamukten – Uji efikasi pupuk cantik Cap Kuda
- PT. Agrimas Cipta Mandiri – Uji efikasi pupuk Wuxal basis
- PT. Agrimas Cipta Mandiri – Uji efikasi pupuk majemuk Real Steany
- PT. Jaya Abadi Manunggal Sejati – Uji efikasi pupuk Nutrisi Saputra
- PT. Bogor Highgrow – Uji efikasi pupuk Higrow Super Tani
- PT. Saprotan N. AgroUtama – Uji efikasi herbisida Posat SA & 865
- PT. Ragam Mandiri – Uji efikasi Maron 50 f & Godam 520 SL
- PT. Windu Kamukten – Uji efikasi herbisida Tarnat 80v/p & DMA6
- PT. Pijar Nusa Pasifik – Uji efikasi Insektisida Furadan 3 G
Kerjasama dengan lembaga/ instansi dalam negeri
- Pusat Penelitian Perkebunan Gula – kerja-sama aplikasi kebun orientasi varietas dan introduksi varietas unggul baru lokal.
- Balai Penelitian Bioteknologi Genetika Tanaman Pangan (BALITBIOGENTAN) Bogor mengenai aplikasi varietas tebu Rekayasa genetika
- Universitas Jember – penelitian tanaman tebu rekayasa genetik metoda SPS (sucrose phospate syntase).
- Institut Teknologi Bandung – penelitian mengenai rekayasa genetic metoda PFP (pyrophospate fructose phospo- fructokinase) dan gula platinosa.
- Institut pertanian Bogor – peneletian mengenai tebu rekayasa genetika efisien pupuk Phospat gen PS-IPB 1 (phytase)
- Balai Penelitian dan Pengembangan Mutu Benih – penelitian mengenai sertifikasi mutu benih kebun bibit di unit-unit usaha.
Kerjasama Luar Negeri
- Ajinomoto International Inc. Japan – penelitian tanaman tebu rekayasa genetika toleran kekeringan.
- CIRAD - introduksi varietas unggul ex luar negeri.
- Program Uitzending Manager (PUM) pengganti dari The Nederland Management Cooperation – kerja-sama peningkatan kinerja petani, bidang tanaman, bidang pabrikasi dan pengolahan, bidang kesehatan / rumah sakit.